retina - Retinal
İsimler | |
---|---|
Tercih edilen IUPAC adı
(2 e , 4 e , 6 e , 8 e ) -3,7-dimetil-9- (2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-il) nona 2,4,6,8-tetraenal |
|
Diğer isimler
|
|
tanımlayıcılar | |
3B model ( JSmol )
|
|
chebi | |
Kimyasal Örümcek | |
ECHA Bilgi Kartı | 100.003.760 |
PubChem Müşteri Kimliği
|
|
ÜNİİ | |
CompTox Panosu ( EPA )
|
|
|
|
|
|
Özellikler | |
C 20 H 28 O | |
Molar kütle | 284.443 g·mol -1 |
Dış görünüş | Petrol eterinden turuncu kristaller |
Erime noktası | 61 - 64 °C (142 - 147 °F; 334 - 337 K) |
Neredeyse çözünmez | |
Yağda çözünürlük | Çözünür |
Bağıntılı bileşikler | |
Bağıntılı bileşikler
|
retinol ; retinoik asit ; beta-karoten ; dehidroretinal ; 3-hidroksiretinal; 4-hidroksiretinal |
Aksi belirtilmedikçe, veriler standart durumdaki malzemeler için verilmiştir (25 °C [77 °F], 100 kPa'da). |
|
doğrulamak ( nedir ?) | |
Bilgi kutusu referansları | |
Retinal ( retinaldehit olarak da bilinir ) bir polien kromoforudur . Opsin adı verilen proteinlere bağlı olan retina, görsel algının (görme) ışık algılama aşaması olan görsel fototransdüksiyonun kimyasal temelidir .
Bazı mikroorganizmalar, ışığı metabolik enerjiye dönüştürmek için retina kullanır.
A vitamininin birçok formu vardır - bunların hepsi retinaya dönüştürülür ve bunlar olmadan yapılamaz. Retinanın kendisi, bir hayvan tarafından yenildiğinde bir A vitamini formu olarak kabul edilir. Retinaya dönüştürülebilen farklı moleküllerin sayısı türden türe değişir. Retina, başlangıçta retinen olarak adlandırıldı ve A vitamini aldehit olduğu keşfedildikten sonra yeniden adlandırıldı .
Omurgalı hayvan et şirketinden retina Alıp ya da retina üretmek karotenoidler - birinden α-karoten veya β-karoten - her ikisi de olan karotenler . Ayrıca onu bir tür ksantofil olan β-kriptoksantin'den üretirler . Bu karotenoidler, bitkilerden veya diğer fotosentetik organizmalardan elde edilmelidir . Başka hiçbir karotenoid hayvanlar tarafından retinaya dönüştürülemez. Bazı etoburlar herhangi bir karotenoidi hiç dönüştüremezler. A vitamininin diğer ana formları - retinol ve kısmen aktif bir form olan retinoik asit - her ikisi de retinadan üretilebilir.
Böcekler ve kalamar gibi omurgasızlar, görsel sistemlerinde diğer ksantofillerden dönüşümden türetilen hidroksillenmiş retina formlarını kullanır .
A vitamini metabolizması
Canlı organizmalar, karotenoidlerin geri dönüşümsüz oksidatif bölünmesiyle retina (RAL) üretir.
Örneğin:
- beta-karoten + O 2 → 2 retinal,
bir beta-karoten 15,15'-monooksijenaz veya bir beta-karoten 15,15'-dioksijenaz tarafından katalize edilir .
Karotenoidler retinanın öncüleri olduğu gibi, retinal de A vitamininin diğer formlarının öncüsüdür. Retina, A vitamininin taşıma ve depolama formu olan retinol (ROL) ile birbirine dönüştürülebilir :
retinol dehidrojenazlar (RDH'ler) ve alkol dehidrojenazlar (ADH'ler) tarafından katalize edilir .
Retinol, A vitamini alkolü veya daha sıklıkla sadece A vitamini olarak adlandırılır . Retinal ayrıca retinoik aside (RA) oksitlenebilir :
- retinal + NAD + + H 2 O → retinoik asit + NADH + H + (RALDH tarafından katalize edilir)
- retinal + O 2 + H 2 O → retinoik asit + H 2 O 2 (retinal oksidaz tarafından katalize edilir),
retinaldehit dehidrojenazlar (RALDH'ler) olarak da bilinen retinal dehidrojenazlar ve ayrıca retinal oksidazlar tarafından katalize edilir .
Bazen A vitamini adı Retinoik asit, asit , omurgalı hayvanlarda önemli bir sinyal molekülü ve bir hormondur.
Görüş
Retina konjuge bir kromofordur . İçinde insan gözü , retina başlayan bir 11- cis retinal konfigürasyon olan, - bir yakalama üzerine foton doğru dalga boyunun - bir bütün-içine düzeltir , trans -retinal konfigürasyon. Bu konfigürasyon değişikliği , insan beyni tarafından ışığın veya görüntülerin algılanmasıyla sonuçlanabilecek kimyasal bir sinyal kaskadı tetikleyen retinadaki bir opsin proteinine karşı iter . Kromoforun absorbans spektrumu, bağlı olduğu opsin proteini ile etkileşimlerine bağlıdır, böylece farklı retinal-opsin kompleksleri farklı dalga boylarındaki (yani farklı ışık renklerindeki) fotonları emecektir.
Opsinler
Opsins proteinleri ve bulunan retinal bağlayıcı görsel pigmentlerdir fotoreseptör hücrelerinin içinde retinalarının gözlerin. Bir opsin, altı halka ile birbirine bağlanan yedi transmembran alfa-helis demeti halinde düzenlenir . Olarak çubuk hücreleri , opsin molekülleri bütünüyle hücre içinden olan diskler zarlarında, gömülür. N-son molekülün başlığı, diskin iç kısmı içine uzanır ve C-terminali kuyruk hücre sitoplazması içine doğru uzanır. Koni hücrelerinde, diskler hücrenin plazma zarı tarafından tanımlanır , böylece N-terminali başı hücrenin dışına uzanır. Retina, bir Schiff baz bağı yoluyla proteinin C-ucuna en yakın transmembran sarmal üzerindeki bir lizine kovalent olarak bağlanır . Schiff bazı bağının oluşumu, oksijen atomunun retinadan ve iki hidrojen atomunun lizinin serbest amino grubundan çıkarılmasını ve H 2 O verilmesini içerir . Retiniliden, oksijen atomunun retinadan çıkarılmasıyla oluşan iki değerli gruptur ve bu nedenle opsinler olarak adlandırılmıştır. retiniliden proteinleri .
Opsinler prototipik G protein-bağlı reseptörlerdir (GPCR'ler). Sığırların çubuk hücrelerinin opsin'i olan sığır rodopsin, X-ışını yapısını belirleyen ilk GPCR idi . Sığır rodopsin 348 amino asit kalıntısı içerir. Retina kromofor Lys bağlanan 296 .
Memeliler özel Opsin kromofor olarak retina kullanımı olsa da, diğer hayvan grupları, ek olarak yakın retina ilgili dört kromoforları kullanımı: 3,4-didehydroretinal (vitamin A 2 ), (3 R ) -3-hydroxyretinal, (3 S ) -3- hydroxyretinal (her ikisi de A vitamini 3 ) ve (4 R ) -4-hydroxyretinal (vitamin A 4 ). Birçok balık ve amfibi, dehidroretinal olarak da adlandırılan 3,4-didehidroretinal kullanır . Haricinde dipterana Alt takım Cyclorrhapha (sözde yüksek sinekler), bütün böceklerin (kullanımı incelenmiştir R -) enantiomeri , 3-hydroxyretinal arasında. ( R )-enantiyomeri, eğer 3-hidroksiretinal doğrudan ksantofil karotenoidlerinden üretiliyorsa beklenecektir . Drosophila dahil olmak üzere siklorhaphanlar ( 3S )-3-hidroksiretinal kullanır. Ateşböceği kalamar kullanımı (4 tespit edilmiştir R ) -4-hydroxyretinal.
görsel döngü
Görsel döngü, fototransdüksiyonun ön ucu olan dairesel bir enzimatik yoldur . 11- cis- retinali yeniler. Örneğin memeli çubuk hücrelerinin görsel döngüsü şu şekildedir:
- all- trans -retinil ester + H 2 O → 11 cis retinol + yağlı asit ; RPE65 izomerohidrolazlar;
- 11- cis -retinol + NAD + → 11- cis -retinal + NADH + H + ; 11- cis- retinol dehidrojenazlar;
- 11- cis- retinal + aporhodopsin → rodopsin + H 2 O olduğu; lizine Schiff baz bağı oluşturur , -CH=N + H-;
- rodopsin + hv bağıntısı → Metarodopsin II (yani, 11- cis- photoisomerizes tüm- trans ):
- (rodopsin + hν → fotorhodopsin → bathorhodopsin → lumirhodopsin → metarhodopsin I → metarhodopsin II);
- Metarodopsin II + H 2 O → aporhodopsin + bütün- trans- retinal;
- all- trans -retinal + NADPH + H + → all- trans -retinol + NADP + ; all- trans- retinol dehidrojenazlar ;
- all- trans -retinol + yağlı asit → all- trans- retinil ester + H 2 O olduğu; lesitin retinol asiltransferazlar (LRAT'ler).
Adım 3, 4, 5 ve 6, çubuk hücre dış segmentlerinde meydana gelir ; Adım 1, 2 ve 7, retina pigment epiteli (RPE) hücrelerinde meydana gelir.
RPE65 izomerohidrolazlar, beta-karoten monooksijenazlarla homologdur ; Drosophila'daki homolog ninaB enzimi hem retinal oluşturan karotenoid-oksijenaz aktivitesine hem de all- trans ila 11- cis izomeraz aktivitesine sahiptir.
mikrobiyal rodopsinler
All- trans- retinal ayrıca bakteriorhodopsin , channelrhodopsin ve halorhodopsin gibi mikrobiyal, opsinlerin temel bir bileşenidir . Bu moleküllerde ışık, all- trans- retinalin 13- cis retinal olmasına neden olur , bu daha sonra karanlık durumda all- trans- retinal'e geri döner . Bu proteinler, hayvan opsinleriyle evrimsel olarak ilişkili değildir ve GPCR'ler değildir; ikisinin de retina kullanması gerçeği yakınsak evrimin bir sonucudur .
Tarih
Amerikalı biyokimyacı George Wald ve diğerleri, 1958 yılına kadar görsel döngünün ana hatlarını çizmişlerdi . Wald, çalışmaları için Haldan Keffer Hartline ve Ragnar Granit ile birlikte 1967 Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü'nün bir payını kazandı .
Ayrıca bakınız
Referanslar
daha fazla okuma
- Fernald, Russell D. (2006). "Gözlerin Evrimine Genetik Bir Işık Tutmak". Bilim . 313 (5795): 1914–1918. Bibcode : 2006Sci...313.1914F . doi : 10.1126/science.1127889 . PMID 17008522 . S2CID 84439732 .
- Amora, Tabitha L.; Ramos, Lavoisier S.; Galan, Jhenny F.; Birge, Robert R. (2008). "Koyu Kırmızı Koni Pigmentlerinin Spektral Ayarlanması" . Biyokimya . 47 (16): 4614–20. doi : 10.1021/bi702069d . PMC 2492582 . PMID 18370404 .
- Barlow, HB; Levick, WR; Yoon, M. (1971). "Kedinin retina gangliyon hücrelerinde ışığın tek kuantum yanıtları". Vizyon Araştırması . 11 (Ek 3): 87–101. doi : 10.1016/0042-6989(71)90033-2 . PMID 5293890 .
- Baylor, DA; Kuzu, TD; Yau, KW (1979). "Tek fotonlara retina çubuklarının tepkileri" . Fizyoloji Dergisi . 288 : 613-634. doi : 10.1113/jphysicol.1979.sp012716 (31 Mayıs 2021 etkin değil). PMC 1281447 . PMID 112243 .CS1 bakımı: Mayıs 2021 itibariyle DOI etkin değil ( bağlantı )
- Hayran, Jie; Woodruff, Michael L; Cilluffo, Marianne C; Crouch, Rosalie K; Fain, Gordon L (2005). "Karanlık yetiştirilmiş Rpe65 nakavt farelerin çubuklarında transdüksiyonun Opsin aktivasyonu" . Fizyoloji Dergisi . 568 (1): 83–95. doi : 10.1113/jphysicol.2005.091942 . PMC 1474752 . PMID 15994181 .
- Hecht, Selig; Shlaer, Simon; Pirenne, Maurice Henri (1942). "Enerji, Kuantum ve Vizyon" . Genel Fizyoloji Dergisi . 25 (6): 819-840. doi : 10.1085/jgp.25.6.819 . PMC 2142545 . PMID 19873316 .
- Kawaguchi, Riki; Yu, Jiamei; Honda, Jane; Hu, Jane; Whitelegge, Julian; Ping, Peipei; Wiita, Patrick; Bok, Dean; Sun, Hui (2007). "Retinol Bağlayıcı Protein İçin Bir Membran Reseptörü, A Vitamininin Hücresel Alımını Aracılık Eder". Bilim . 315 (5813): 820-825. Bibcode : 2007Sci...315..820K . doi : 10.1126/science.1136244 . PMID 17255476 . S2CID 25258551 .
- Kloer, Daniel P.; Ruch, Sandra; El-Babil, Salim; Bey, Peter; Schulz, Georg E. (2005). "Retina Oluşturan Karotenoid Oksijenazın Yapısı" . Bilim . 308 (5719): 267-269. Bibcode : 2005Sci...308..267K . doi : 10.1126/science.1108965 . PMID 15821095 . S2CID 6318853 .
- Luo, Dong-Gen; Xue, Tian; Yau, King-Wai (2008). "Vizyon nasıl başlar: Bir macera" . Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri . 105 (29): 9855-9862. Bibcode : 2008PNAS..105.9855L . doi : 10.1073/pnas.0708405105 . PMC 2481352 . PMID 18632568 . İyi bir tarihi inceleme.
- Prado-Cabrero, Alfonso; Scherzinger, Daniel; Avalos, Javier; Al-Babili, Salim (2007). "Mantarlarda Retina Biyosentezi: Fusarium fujikuroi'den Karotenoid Oksijenaz CarX'in Karakterizasyonu" . Ökaryotik Hücre . 6 (4): 650-657. doi : 10.1128/EC.00392-06 . PMC 1865656 . PMID 17293483 .
- Rakip, Efraim; Stoeckenius, Walther (1974). "Işıkla yönlendirilen Proton Alımını ve Adenozin Trifosfat Oluşumunu Katalizleyen Mor Zar Veziküllerinin Yeniden Oluşturulması" . Biyolojik Kimya Dergisi . 249 (2): 662-663. doi : 10.1016/S0021-9258(19)43080-9 . PMID 4272126 .
- Sadekar, Sumedha; Raymond, Jason; Blankenship, Robert E. (2006). "Uzaktan İlişkili Zar Proteinlerinin Korunması: Fotosentetik Reaksiyon Merkezleri Ortak Bir Yapısal Çekirdeği Paylaşıyor" . Moleküler Biyoloji ve Evrim . 23 (11): 2001–2007. doi : 10.1093/molbev/msl079 . PMID 16887904 .
- Salom, David; Lodowski, David T.; Stenkamp, Ronald E.; Le Trong, Isolde; Gölczak, Marcin; Jastrzebska, Beata; Harris, Tim; Ballesteros, Juan A.; Palczewski, Krzysztof (2006). "Rodopsin'in fotoaktive edilmiş protondan arındırılmış bir ara maddesinin kristal yapısı" . Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri . 103 (44): 16123-16128. Bibcode : 2006PNAS..10316123S . doi : 10.1073/pnas.0608022103 . PMC 1637547 . PMID 17060607 .
- Schäfer, Günter; Engelhard, Martin; Müller, Volker (1999). "Arkea'nın Biyoenerjetiği" . Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji İncelemeleri . 63 (3): 570–620. doi : 10.1128/MMBR.63.3.570-620.1999 . PMC 103747 . PMID 10477309 .
- Schmidt, Holger; Kurtzer, Robert; Eisenreich, Wolfgang; Schwab, Wilfried (2006). "Arabidopsis thaliana'dan Karotenaz AtCCD1 Bir Dioksijenazdır" . Biyolojik Kimya Dergisi . 281 (15): 9845–9851. doi : 10.1074/jbc.M511668200 . PMID 16459333 .
- Gönder, Robert; Sundholm, Dage (2007). "Konik kavşağa giden merdiven: Retina izomerizasyonunun hesaplamalı bir çalışması". Fiziksel Kimya A'nın Dergisi . 111 (36): 8766-8773. Bibcode : 2007JPCA..111.8766S . doi : 10.1021/jp073908l . PMID 17713894 .
- Su, Chih-Ying; Luo, Dong-Gen; Terakita, Akihisa; Shichida, Yoshinori; Liao, Hsi-Wen; Kazmi, Manija A.; Sakmar, Thomas P.; Yau, King-Wai (2006). "Parietal-Göz Fototransdüksiyon Bileşenleri ve Potansiyel Evrimsel Etkileri" . Bilim . 311 (5767): 1617-1621. Bibcode : 2006Sci...311.1617S . doi : 10.1126/science.1123802 . PMID 16543463 . S2CID 28604455 .
- Venter, J. Craig ; Remington, K; Heidelberg, JF; Halpern, AL; Rusch, D; Eisen, JA; Wu, D; Paulsen, ben; ve diğerleri (2004). "Sargasso Denizi'nin Çevresel Genom Av Tüfeği Sıralaması". Bilim . 304 (5667): 66-74. Bibcode : 2004Sci...304...66V . CiteSeerX 10.1.1.124.1840 . doi : 10.1126/science.1093857 . PMID 15001713 . S2CID 1454587 . Okyanuslar tip 1 rodopsinle doludur.
- Wang, Tao; Jiao, Yuchen; Montell, Craig (2007). "A vitamini üretimi ve Drosophila fototransdüksiyonu için gerekli yolun diseksiyonu" . Hücre Biyolojisi Dergisi . 177 (2): 305–316. doi : 10.1083/jcb.200610081 . PMC 2064138 . PMID 17452532 .
- Waschuk, Stephen A.; Bezerra, Arandi G.; Shi, Lichi; Brown, Leonid S. (2005). "Leptosphaeria rhodopsin: Bir ökaryottan bakteriyodopsin benzeri proton pompası" . Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri . 102 (19): 6879-6883. Bibcode : 2005PNAS..102.6879W . doi : 10.1073/pnas.0409659102 . PMC 1100770 . PMID 15860584 .
- Yokoyama, Shozo; Radlwimmer, F. Bernhard (2001). "Omurgalılarda kırmızı ve yeşil renk görüşünün moleküler genetiği ve evrimi" . Genetik . 158 (4): 1697-1710. doi : 10.1093/genetics/158.4.1697 . PMC 1461741 . PMID 11545071 .
- Briggs, Winslow R.; Spudich, John L., ed. (2005). Fotosensör Alıcıların El Kitabı . Wiley. ISBN'si 978-3-527-31019-7.
- Wald, George (1967). "Nobel Dersi: Görsel Uyarımın Moleküler Temeli" (PDF) . 2009-02-23 alındı .
Dış bağlantılar
- Vizyonun İlk Adımları - Ulusal Sağlık Müzesi
- Görme ve Işığa Bağlı Moleküler Değişiklikler
- Retina Anatomisi ve Görme Kapasiteleri
- Retina , Imperial College v-chemlib