Oligopeptid - Oligopeptide

Bir tripeptit (örneğin, Val - Gly - Ala ) ile
yeşil işaretlenmiş amino ucuna ( L-Valin ) ve
mavi belirgin karboksil ucundan ( L-Alanin )
Bir tetrapeptid (örneğin Val - Gly - Ser - Ala ) ile
yeşil işaretlenmiş amino ucu ( L-valin ) ve
mavi belirgin karboksil ucu ( L-alanin )

Genellikle peptit ( oligo- , "birkaç") olarak adlandırılan bir oligopeptit , iki ila yirmi amino asitten oluşur ve dipeptitleri , tripeptitleri , tetrapeptitleri ve pentapeptitleri içerebilir . Doğal olarak oluşan oligopeptitlerin ana sınıflarından bazıları, aeruginosinler , siyanopeptolinler , mikrosistinler , mikroviridinler , mikrogininler , anabaenopeptinler ve siklamitleri içerir . Mikrosistinler, içme suyundaki potansiyel toksisite etkileri nedeniyle en iyi şekilde incelenir. Bazı oligopeptitlerin gözden geçirilmesi, en büyük sınıfın siyanopeptolinler (%40.1) ve ardından mikrosistinler (%13.4) olduğunu buldu.

Üretme

Oligopeptid sınıfları ribozomal olmayan peptid sentazları (NRPS) tarafından üretilir , ancak siklamitler ve mikroviridinler ribozomik yollardan sentezlenir .

Örnekler

Oligopeptidlerin örnekleri şunları içerir:

  • Amanitinler - Birkaç farklı mantar türünün karpoforlarından alınan siklik peptitler. Çoğu ökaryotik türde güçlü RNA polimeraz inhibitörleridir , mRNA üretimini ve protein sentezini engellerler. Bu peptitler, transkripsiyon çalışmasında önemlidir. Alfa-amanitin, insanlar veya hayvanlar tarafından yutulduğunda zehirli olan Amanita phalloides türünden ana toksindir .
  • Antipain - Proteaz inhibitörü olarak görev yapan çeşitli bakteriler tarafından üretilen bir oligopeptit .
  • Ceruletide - Belirli dekapeptid Hyla derisinde bulunan caerulea , Avustralya yeşil ağaç kurbağası . Ceruletide, kolesistokinin eylemi ve bileşimi açısından çok ortak noktaya sahiptir . Mide, safra ve pankreas salgısını uyarır; ve belirli düz kaslar . Deneysel hayvan modellerinde pankreatiti indüklemek için kullanılır .
  • Glutatyon - Hücrelerde birçok rolü olan bir tripeptid. İlaçları atılım için daha çözünür hale getirmek için konjuge olur, bazı enzimler için bir kofaktördür, protein disülfid bağının yeniden düzenlenmesinde yer alır ve peroksitleri azaltır.
  • Leupeptinler - Proteaz inhibitörleri olarak işlev gören Actinomycetes tarafından üretilen bir grup asillenmiş oligopeptit. Değişen derecelerde tripsin , plazmin , kallikreinler , papain ve katepsinleri inhibe ettikleri bilinmektedir .
  • Netropsin - Streptomyces netropsis'ten izole edilen bazik bir oligopeptid . Sitotoksiktir ve DNA'nın AT alanlarına güçlü, spesifik bağlanması genetik araştırmaları için yararlıdır.
  • Peptatinler - N Pepsin ve renin gibi asit olan proteazları engellemek üzere işlev görür Aktinomisetlerin kültür süzüntüler, izole edilmiş oligopeptidler -acylated.
  • Peptit T - N -( N -( N (2)-( N -( N -( N -( N - D -Alanil L -seril)- L -threonil)- L -threonil) L -threonil)- L - asparaginil) -L- tirosil) L- treonin. HIV zarf proteini gp120 ile oktapeptid paylaşım dizisi homolojisi. AIDS tedavisinde antiviral ajan olarak faydalı olabilir. Peptit T'de 4-8 amino asitlerden oluşan çekirdek pentapeptit dizisi TTNYT, CD4 reseptörüne bağlanmak için gereken HIV zarf dizisidir.
  • Phalloidin - Esas olarak Amanita phalloides'ten (Agaricaceae) veya ölüm kapağından izole edilen çok toksik bir polipeptit ; mantar zehirlenmesinde ölümcül karaciğer, böbrek ve merkezi sinir sistemi hasarına neden olur; Karaciğer hasarının araştırılmasında kullanılır.
  • Teprotide - Yılan zehirinden, Bothrops jararaca'dan elde edilen peptit ile tamamen aynı olan, insan yapımı bir nonapeptit (Pyr-Trp-Pro-Arg-Pro-Gln-Ile-Pro-Pro). Kininaz II ve ANGIOTENSIN I'i inhibe eder ve bir antihipertansif ajan olarak önerilmiştir.
  • Tuftsin - N- (2) - ((1- ( N- (2) - L -Threonyl) - L lisil) - L -prolyl) - L -arginin. Bir lökofilik gama-globulinin enzimatik bölünmesiyle dalakta üretilen bir tetrapeptid. Kan polimorfonükleer lökositlerin ve özellikle nötrofillerin fagositik aktivitesini uyarır. Peptit, gama-globulin molekülünün Fd fragmanında bulunur.

Ayrıca bakınız

Referanslar

Dış bağlantılar