Deniz anemon sitotoksik proteini - Sea anemone cytotoxic protein

Anemone_cytotox
PDB 1o72 EBI.jpg
fosforilkolin ile kompleks oluşturan gözenek oluşturucu sitolizin sticholysin ii'nin suda çözünür durumunun kristal yapısı
tanımlayıcılar
Sembol Anemone_cytotox
Pfam PF06369
InterPro IPR009104
SCOP2 1kd6 / KAPSAM / SUPFAM
TCDB 1.C.38
OPM süper ailesi 168
OPM proteini 4tsy

Moleküler biyolojide, deniz anemonu sitotoksik proteinleri , toplu olarak sitolizinlerin bir alt sınıfı olan aktinoporinler olarak bilinen öldürücü gözenek oluşturucu proteinlerdir . Yapılarına ve işlevlerine göre birkaç farklı sitolizin grubu vardır . Bu girdi, en çok sayıdaki grubu, 20kDa yüksek düzeyde bazik peptitleri temsil eder. Bu sitolizinler, sfingomyelin içeren membranlarda katyon seçici gözenekler oluşturur . Örnekler arasında gözenek oluşturucu, hemolitik, sitotoksik ve kalp uyarıcı aktiviteler sergileyen ekinatoksinler (Actinia equina'dan), sticholysins (Stichodactyla helianthus'tan), magnificalisinler (Heteractis magnifica'dan) ve tenebrosinler (Actinia tenebrosa'dan) sayılabilir .

Sitolisinler , bir zarla temasa getirildiğinde konformasyonel bir değişikliğe uğrayan ve zara kendiliğinden giren aktif, zara bağlı bir forma yol açan kararlı bir çözünür yapıyı benimser . Genellikle oligomerize üzerinde zar yüzeyinin, delinme önce lipit , çift katmanlar neden hücre için lize . 20kDa deniz anemon sitolizinleri bağlanma için bir fosfokolin lipid baş grubuna ihtiyaç duyar, ancak toksinin membran geçirgenliğini arttırması için sfingomyelin gereklidir . Kristal yapıları equinatoxin II ve sticholysin II her iki on şeritlerin oluşan kompakt bir beta sandviç ortaya yaprak osmotin benzer topolojisi olan iki kısa alfa-sarmalları, her tarafında kuşatılmış. Beta sandviç yapısının zara bağlandığına inanılırken , beta tabakasının yüzeyinde yatan üç dönüşlü bir alfa sarmalının , muhtemelen zarın sarmal tarafından nüfuz etmesiyle zar gözenek oluşumunda rol oynayabileceğine inanılmaktadır .

Referanslar

Bu makale, kamu malı Pfam ve InterPro'dan metin içermektedir : IPR009104